Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms