Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC17A7Q9P2U7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms