Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms