Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms