Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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