Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms