Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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