Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms