Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms