Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms