Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms