Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms