Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms