Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms