Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms