Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms