Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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SGF29Q96ES7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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