Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECHDC3Q96DC8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms