Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP13Q92995 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP13Q92995 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP13Q92995 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms