Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms