Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms