Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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