Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms