Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC33Q8N5R6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms