Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms