Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms