Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms