Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms