Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms