Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms