Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms