Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms