Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPHKAPQ2M3C7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPHKAPQ2M3C7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms