Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MICAQ29983 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms