Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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