Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP2Q16527 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms