Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK5Q16478 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK5Q16478 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK5Q16478 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.9 ms