Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GRIK4Q16099 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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