Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NEDD8Q15843 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NEDD8Q15843 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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