Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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