Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PDCD1Q15116 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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PDCD1Q15116 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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PDCD1Q15116 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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PDCD1Q15116 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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PDCD1Q15116 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PDCD1Q15116 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PDCD1Q15116 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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