Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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