Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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