Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms