Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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