Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms