Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGB3BPQ13352 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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