Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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