Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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