Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SREBF2Q12772 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms